Farmaceutické čisté prostory slouží především k výrobě mastí, pevných léků, sirupů, infuzních setů a dalších léčiv.Soulad s normami GMP a ISO 14644 je v tomto odvětví běžnou praxí.Hlavním cílem je vytvoření vědeckého a vysoce přísného sterilního výrobního prostředí se zaměřením na přesnou kontrolu procesů, operací a systémů řízení a striktní eliminaci jakékoli potenciální biologické aktivity, prachových částic a křížové kontaminace.To má zajistit výrobu vysoce kvalitních a hygienických léků.Důkladné přezkoumání výrobního prostředí a pečlivé environmentální kontroly jsou zásadní.Pokud je to možné, doporučuje se používat energeticky úsporné technologie.Poté, co je čistá místnost plně kvalifikována, musí před zahájením výroby získat souhlas místního úřadu pro potraviny a léčiva.